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1. Yano, D., Bessho-Uehara, M., Paitio, J. et al. 14-3-3 proteins are luciferases candidate proteins from lanternfish Diaphus watasei. Photochemical & Photobiological Sciences (2022). https://doi.org/10.1007/s43630-022-00311-2
   深海魚ハダカイワシのルシフェラーゼを精製画分から、14−3−３タンパク質が検出された。
   深海魚

2. Ramesh, Chatragadda, and Manabu Bessho-Uehara. "Acquisition of bioluminescent trait by non-luminous organisms from luminous organisms through various origins." Photochemical & Photobiological Sciences 20, no. 11 (2021): 1547-1562.
   生物が新しい機能を獲得する進化のプロセスには、ゲノムに新しい変異を獲得する以外にも、別の方法がいくつか知られています。例えば、遺伝子水平伝播や共生、そして、餌生物による鍵となる物質の獲得などが挙げられます。このような、いわゆる別解のような方法で発光能力を獲得した進化の方法、あるいはそのポテンシャルを持つ事例についてまとめた総説論文です
    

3. Bessho-Uehara, Manabu, et al. "Evidence for de novo Biosynthesis of the Luminous Substrate Coelenterazine in Ctenophores." iScience 23.12 (2020): 101859. (オープンアクセスです)
   海洋発光生物にとってなくてはならない分子セレンテラジンは、これまで、誰がどのように作っているのかについてほとんどわかっていませんでした。水族館とのコラボレーションにより、クシクラゲがセレンテラジンの生産者であることを突き止めました。
   （名古屋大学から​プレスリリース）
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4. Bessho-Uehara Manabu, Warren R. Francis, and Steven HD Haddock. "Biochemical characterization of diverse deep-sea anthozoan bioluminescence systems." Marine Biology 167.8 (2020): 1-19.(オープンアクセスです)
   花虫綱（サンゴやイソギンチャク、ヤギ）の発光の進化を明らかにするため深海の発光種を調査した。八放サンゴ亜綱（ウミシイタケやヤギ、ソフトコーラルの仲間）の発光メカニズムが共通していることから、発光の起源が八放サンゴ亜綱の共通祖先である可能性が示唆された。さらに、これまで発光することが知られていなかったイソギンチャク（六放サンゴ亜綱）1種とソフトコーラルなど八放サンゴ亜綱で3種（うち２つが新しい亜目、科）が新たに発光種であることを発見した。Blogに解説あります。PR動画も必見です。
   この研究はJournalのEditorによりHighlight Articleに選ばれました。Editorial
   （名古屋大学から​プレスリリース）
    

5. Bessho-Uehara Manabu, Naoyuki Yamamoto, Shuji Shigenobu, Hitoshi Mori, Keiko Kuwata, and Yuichi Oba. "Kleptoprotein bioluminescence: Parapriacanthus fish obtain luciferase from ostracod prey." Science Advances 6, (2020): eaax4942. (オープンアクセスです)
   浅海性の発光魚キンメモドキのルシフェラーゼがウミホタルのルシフェラーゼであることを発見。盗タンパク質現象を世界で初めて発見、概念の提唱をした。Blogに解説があります。
   （JSTから​プレスリリース）
    

6. ​Timothy R Fallon, Sala E Lower, Chin-Ho Chan, Manabu Bessho-Uehara, Gravin J Martin, Adam J Bewick, Megan Behringer, Humberto J Debat, Isaac Wong, John C Day, Anton Suvorov, Christian J Silva, Kathrin F Stanger-Hall, David W Hall, Robert J Schmitz, David R Nelson, Sara M Lewis, Shuji Shigenobu, Seth M Bybee, Amanda M Larracuente, Yuichi Oba, Jing-Ke Weng. "Firefly genomes illuminate parallel origins of bioluminescence beetles." eLife (2018).(オープンアクセスです)
   ​ホタル２種（ヘイケボタルとアメリカのピラリス）とヒカリコメツキ１種のゲノムを比較した論文。配列情報はFirefly baseでオープンになっており、web server上でBLASTなどもできる。発光甲虫は[ホタル・フェンゴデス・イリオモテボタル]の系統と、[ヒカリコメツキ]の２つの系統にまとまっている。二つの系統が離れているにも関わらず、ルシフェリンの構造が同一であり、また、ルシフェラーゼ遺伝子の相同性が高いことからこれらの昆虫における発光の進化が１回なのか複数回だったのかは、ダーウィン時代から長く続く論争であった。本論文の主な発見の一つに、ホタルとコメツキは進化の過程で独立に発光を獲得したことがわかった。
   ​　そのほかにも、ホタルの発光器に特有な遺伝子や、毒（ルシブファジン）に関する遺伝子、共生バクテリアがいるかもしれないこと、発光器に特有のオプシンが発現していることなどを新たに報告した。
   （基礎生物学研究所から​プレスリリース）
    

7. Bessho-Uehara, Manabu, Kaori Konishi, and Yuichi Oba. "Comparative analysis of firefly luciferase genes: Evolution of the intron-exon structure." Lampyrid (2017).
   ホタル亜科とマドボタル亜科でLuc2が取れてきたので、その遺伝子構造がluciferaseの進化の中でどれくらい保存されているかを調べた研究。結果はホタル科の中で、既知のルシフェラーゼはLuc1もLuc2もどちらもその遺伝子構造、すなわちイントロンとエキソンの位置関係は完全に保存されていた。ただし、１種だけ例外があった（後述）。さらに、コメツキも含めた解析を行い、甲虫ルシフェラーゼでは、すべて7 exon-6 intronのパターンとそのジャンクションの位置が保存されていた。先の例外というのが、韓国の研究者が調べた韓国産と中国産のアキマドボタルPyrocoelia rufa​のLuc1(PrLuc1-K&C)では、イントロンの位置が60 nucleotide (nt) 5'側にずれていた。Intron sliding/ shiftは1-15 nt の範囲では知られているが、60 ntと長いずれは知られていない。これらの個体の入手は困難なので、対馬に生息するアキマドボタルを使って、Luc1の遺伝子構造を調べたところ、他のLuc1と同じ形だったので、どうやら先人のミスの可能性が高そう。
    

8. ​Manabu Bessho-Uehara, Kaori Konishi, and Yuichi Oba. "Biochemical characteristics and gene expression profiles of two paralogous luciferases from the Japanese firefly Pyrocoelia atripennis (Coleoptera, Lampyridae, Lampyrinae): Insight into the evolution of firefly luciferase genes." Photochemical & Photobiological Sciences (2017).
   沖縄の八重山諸島に生息するヤエヤママドボタル（オオシママドボタルとも）から2つのルシフェラーゼPatLuc1とPatLuc2を発見し、その生化学的性質や遺伝子発現部位を発生ステージ（成長段階）別に調べた研究。その結果、ホタル科は全てLuc1とLuc2をもち、それらの使われ方が共通していることが示唆された。これはホタル科の共通祖先で発光能力が獲得されたあと、ルシフェラーゼの遺伝子重複と発現時期の使い分けが、亜科に分岐するまでの進化的にごく短い時間でほぼ同時に起こった可能性を示唆している。
    

9. Bessho‐Uehara, Manabu, and Yuichi Oba. "Identification and characterization of the Luc2‐type luciferase in the Japanese firefly, Luciola parvula, involved in a dim luminescence in immobile stages." Luminescence (2017).
   名古屋大学で捕まえたヒメボタルを使った研究。陸棲ホタルにもLuc2があることが明らかとなった。ホタルの発光器からの発光色は、Luc1によって生み出され、緑から黄色まで様々である。発光器（Luc1)が黄色く光るヒメボタルでも、蛹（Luc2）の発光色は緑色であることがわかった。おそらく、Luc2は毒を持つことの警告のために使われており、他生物の視覚感受に適したスペクトルにチューニングされているのだろう。
    

10. Oba, Yuichi, Furuhashi, Mana, Bessho, Manabu, Sagawa, Shingo, Ikeya, Haruyoshi, and Inouye, Satoshi. "Bioluminescence of a firefly pupa: involvement of a luciferase isotype in the dim glow of pupae and eggs in the Japanese firefly, Luciola lateralis." Photochemical & Photobiological Sciences 12.5 (2013): 854-863.
    ゲンジボタルはルシフェラーゼを２つ持つことが2010年に明らかとなったが、2つの遺伝子がどう使い分けられているのかはわかっていなかった。飼育が可能なヘイケボタルを使うことで、Luc2を持つことを明らかにし、さらに、Luc1とLuc2がどのように使い分けられているのかを明らかにした。Luc1は幼虫と蛹、成虫の発光器で発現しており、Luc2は卵と蛹、メス成虫の卵巣で発現していた。